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- Equidad: Está vinculado a la justicia, imparcialidad e igualdad social. Es particularmente importante en la región del Pacífico Este Tropical Central en cuanto a la equidad de grupos de género y a la equidad con grupos sociales vulnerables.
- Soberanía: Se refiere a la relevancia de la autoridad y autonomía de los países miembros de la iniciativa, sobre sus propios territorios y legislación.
- Precautorio: Cuando haya peligro de considerable reducción o pérdida de diversidad biológica, la falta de certeza científica absoluta no deberá utilizarse como razón para postergar la adopción de medidas que impidan o minimicen dicho peligro (Principio 15 de la Conferencia de Río de Janeiro).
- Transparencia: Las decisiones que se tomen deben apegarse a los procesos de gobernanza previamente acordados y toda información y comunicación relativa al tratamiento de los datos debe ser accesible y fácil de entender.
- Manejo adaptativo: Consiste en el diseño de una estrategia (muchas veces basado en el conocimiento científico), su implementación, monitoreo y adaptación para lograr un aprendizaje.